Nat Genet: 人类癌症中病毒地理分布

2022-01-24 12:17 来源:武汉妇科医院

比利时乳癌症深入研究院 Peter Lichter 团队最新深入研究探索了人类乳癌症里病原体的分布区。日前《自然—遗传学》在线刊载了这一成果。

作为泛乳癌全部都是基因组分析联盟的一部分,该统计数据库系统收集了 38 个型式的 2658 例乳癌症样本的全部都是基因组和一部分RNA全部都是基因组测序统计数据,深入研究技术人员利用共识的方法,结合了 3 个独立统计数据库系统用以系统地深入研究潜在的病原体病菌。在 382 个基因组和 68 个RNA组统计数据集里都检测到了病原体存在。深入研究发现,已知的与方面的病原体,如爱泼斯坦—巴尔病原体(EBV)、脑膜炎病原体(HBV)和人瘤病原体(HPV)的检出率都很更高。

这项深入研究了解到了头颈乳癌里 HPV 和驱动基因变异的显着政治性以及 HPV 与 APOBEC 变异外观上的方面性,这表明抗病原体防御能力下降是宫颈乳癌、膀胱乳癌和头颈乳癌的诱因。对于 HBV、HPV16、HPV18 和腺方面病原体 2,病原体结合与基因组拷贝数的大面积改变有关。在 TERT 转录处的结合与端粒酶的更高强调有关,从而明显酪氨酸了该的发育流程。内源性逆RNA病原体的更高强调与肾乳癌症状较差的生存期有关。

类似出处:

Zapatka, M., Borozan, I., Brewer, D.S. et al. The landscape of viral associations in human cancers. Nat Genet (2020). https://doi.org/10.1038/s41588-019-0558-9.

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